养殖菌种的使用方法根据不同的养殖环境和需求有所不同。以下是一些常见的使用方法：
在肉兔养殖中的使用方法
添加到日粮中：将养殖菌种粉剂原种培育成菌液，用水稀释后与肉兔日粮充分混匀，直接投料饲喂。
添加到饮水中：将水与养殖菌种菌液按1:200的比例添加混合，直接添加水槽，让肉兔自由饮水，长期使用可促进肠道菌群平衡，预防拉稀。
除臭降氨：将养殖菌种菌液和水按1:50的比例稀释，均匀喷洒兔舍、幼兔运动场及粪尿沟等，以灭病原微生物或抑制其生长繁殖，达到除臭降氨的效果。
在水产养殖中的使用方法
光合菌：夏季使用光合菌可脱硫降氨氮，分解小分子有机质，净化水质，抑制有害菌和有害藻类的生长，提高水产养殖动物的免疫力。
EM菌：包含多种有益菌，主要用于稳水，提高苗种成活率，辅助肥水、发酵、粪肥、造化饲料等，改善水质，稳定水质，促进鱼虾蟹的生长，减少病原微生物。
乳酸菌：属于厌氧菌，不耗氧，可分解小分子有机物，降低水体酸碱度，稳定PH值，提高消化酶活性，促进营养物质消化吸收，抑制有害藻类生长。
芽孢杆菌：分解水体中的大分子有机质，转化成小分子无机盐，起到净水作用，同时为藻类和水草提供养分，肥水，配合改水产品可消除池塘内的不良水色，使水色达到优质状态。
使用注意事项
了解菌种特性：根据水质特点、处理目标和操作条件选择合适的菌种。
合理使用量：根据水体污染程度和处理规模合理计算菌种使用量，避免浪费或不足。
维持适宜环境：确保菌种生长的最佳温度、pH值、溶解氧等环境条件。
防止污染：菌种使用前应严格筛选和检测，使用过程中采取有效的隔离和消毒措施。
定期评估效果：通过定期检测水质指标和观察菌种生长状态，及时调整优化使用方法。
这些方法可以帮助您在养殖过程中更有效地利用菌种，达到改善水质、促进动物生长和预防疾病的目的。