筛选养殖蚯蚓的方法主要有以下几种：
自制筛子筛选法
制作两个大小相同的筛子，筛孔大小不同，一个为3毫米，一个为1毫米。
将筛子合页折叠起来，上孔大下孔小。
将大小蚯蚓、蚓粪、饲养基一起倒入筛中，放在日光或灯光下（最好是蓝光或紫外线光），使蚯蚓钻过筛孔落到细筛上，小蚯蚓则再通过细筛孔落到下面的容器里。
剩在筛具上面的是蚓粪和土。
振动筛取法
将架床上的蚯蚓、蚓粪倒入3毫米筛孔的筛子上，来回振动。
将蚓粪、蚓卵筛漏到下边的容器里，再将剩在筛上的成蚓采收下来。
光照法
在蚯蚓床旁边空地处垫上一块塑料薄膜。
将蚓床上的基料和蚯蚓一起移到塑料薄膜上，平铺。
根据蚯蚓怕光的原理，蚯蚓会慢慢钻下去，过几分钟后，在面上看不到蚯蚓即可扒掉一层基料，然后再用铁钯松一松，让蚯蚓继续往下钻，看不见了再扒掉一层土，循序渐进，到最后基料扒完了就全是蚯蚓。
筛网分离法
利用特制的筛子，将采集到的成蚓与幼蚓分开。筛孔以幼蚓能通过而成蚓无法穿过为度。
将待分离的混合蚓放置筛中，暴露于强光下，幼蚓迅速经网眼下逃，成蚓则大多留在筛中。
选择优质种蚓
选择环带达到性成熟的蚯蚓，环带红晕粗壮明显。
体态体形健壮饱满，活泼爱动，爬行迅速，粗细均匀，无萎缩现象。
色泽鲜亮，呈现本品种特有颜色。
对光照的敏感程度较高，遇强光时逃避迅速。
原体蚯蚓具有全信息性的再生能力，截体数段的残体均可在伤口愈合的同体独立形成一复原整体。在选种时，剔除退化、短小、体色异常、病态衰老的个体。
避免近亲繁殖
选择个体较大、表面光滑、生殖能力较强的蚯蚓。
将大小蚯蚓分养，避免近亲交配，提高繁殖率。
通过以上方法，可以有效地筛选和选择适合养殖的蚯蚓，提高养殖效率和成功率。