滞纳金的计算方式如下：
计算公式
滞纳金 = 逾期未缴纳税款金额 × 滞纳金利率 × 逾期天数。
具体要素
逾期未缴纳税款金额：指实际逾期未缴纳的税款金额。
滞纳金利率：根据当地税法规定的标准利率，通常是日万分之五（0.05%）。
逾期天数：从税款到期日到实际缴纳日期之间的天数。
计算示例
例如，如果A公司应缴税款为12872.59元，因特殊情况晚缴纳了389天，则滞纳金计算如下：
滞纳金 = 12872.59元 × 0.05% × 389天 = 2503.72元。
法律依据
《中华人民共和国税收征收管理法》第三十二条明确规定了纳税人未按规定期限缴纳税款的，税务机关可以责令限期缴纳，并从滞纳税款之日起按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。
会计处理
企业缴纳滞纳金属于“营业外支出”科目。具体会计分录为：借：营业外支出，贷：银行存款。
综上所述，滞纳金的计算是基于逾期未缴纳税款的金额、滞纳金利率和逾期天数三个因素，通过公式计算得出。这种计算方式具有明确的法律依据，并在会计上也有相应的规定。