补办港澳通行证的流程如下：
报警并取得报警回执
在港澳地区丢失，需先报警，并获取报警回执。
前往中国旅行社
凭报警回执，前往香港或澳门的中国旅行社申请补办手续。
填写申请表格
填写《中华人民共和国入出境通行证申请表》。
提交身份证明文件
提供居民身份证、户口簿或其他户籍证明的复印件，并交验原件。
提交照片
提供近期免冠彩色照片，尺寸通常为48x33mm。
支付费用
使用银行卡或其他支付方式支付相关费用。
领取临时通行证
根据工作人员的指示，在指定时间到原受理点领取临时通行证。
办理离境手续
领取临时通行证后，需亲自前往香港入境事务处办理离境手续确认在港逗留期限后方可离港。
请注意，补办时间可能因地区不同而有所差异，户籍地一般需要15个工作日，非户籍地可能需要30个工作日。