养殖粪便的储存方法有多种，以下是一些常见且有效的方法：
垫圈法
在畜舍内垫上大量的秸秆、杂草、泥炭、干细土等物质。
这种方法可以吸收尿液，保存肥分，同时减少畜栏的臭气，保持干燥清洁的环境，有利于家畜的健康。
堆粪场
适合干清方式清粪或经过固液分离的固态粪便的贮存。
堆粪场通常建在远离牛舍的牛场下风向，大小需考虑牛场规模和牛粪贮存时间。
用作肥料还田的牛场，应综合考虑用肥的季节性变化，设计并建造足够容量的堆粪场。
贮粪池
一般建造于地下，选用水泥预制板封顶，贮存固液混合的粪便和污水。
贮粪池应有防渗、防漏、防雨等功能，适用于水冲方式清粪的牛场。
污水池
用来贮存牛舍排出的尿液和冲洗污水，堆粪场排水沟的污水也通过管道送至污水池。
污水池通常建在牛舍外地势低处，与运动场方向相反，池底和墙体表面需做好防水工作，顶部用水泥预制板封顶。
全贮存零排放法
将粪便污水和冲洗水直接倒入贮存池内，池内不做任何处理，主要用于小型养殖场，用于果园和田地，全部作肥料处理利用。
水压式沼气池排放法
将粪便污水和冲洗水倒入水压式沼气池内，沼气池容积在30到100立方米。
该方法只能获取部分沼气，降解处理有限，排放的污染严重。
干稀分离厌氧好氧排放法
将粪便收集存贮，尿液和冲洗水用于厌氧消化处理。
投资较大，占地较大，适用于大型养殖场。
干稀分离厌氧零排放法
粪便收集存贮，尿液和冲洗用水经过厌氧消化处理导入大容量的贮液池，然后经管道排放到对应面积的林地或农田。
冷冻保存法
将粪便采集后存放于-20℃或-80℃的温度中，-80℃被认为是最佳方法。
冷冻可以降低细菌代谢速率，维持粪便中微生物的原始结构与组成，但实际中难以做到立即速冻，且保存不当会影响实验结果。
冷藏保存法
利用低温条件（主要是4°C）降低细胞内核酸内切酶活性，避免DNA快速降解。
储存24小时不会显著改变粪便微生物群落结构，适用于不能立即将样本放入-80℃冰箱的情况。
保存液保存法
由于新鲜粪便样本不易获得且难以快速低温冷冻，可以使用保存液来保存粪便。
但这种方法在实际应用中较少见。
根据以上方法的特点和适用范围，可以选择适合自己养殖场的储存方法。建议大型养殖场可以考虑使用干稀分离厌氧好氧排放法或干稀分离厌氧零排放法，这些方法不仅减少环境污染，还能产生有价值的副产品如沼气。小型养殖场则可以考虑使用全贮存零排放法或堆粪场等方法，简单且经济实用。