可以进行水质检测的部门包括：
产品质量监督检测所：
隶属于技术监督局，负责按照国家标准进行水质检测。
卫生局下属的卫生监督所：
负责饮用水水质的监测，确保水质符合卫生标准。
自来水检测中心：
负责当地自来水的水质检测，确保供水安全。
疾控中心：
承担水质检测和公共卫生相关工作，包括传染病预防和水质监测。
环保局：
负责环境保护，包括水质监测和污染防治。
食品药品监督管理局：
负责食品安全监管，包括饮用水的水质检测。
质量技术监督局：
负责产品质量和技术标准的监督，包括水质检测。
水务局：
负责水资源的管理和水务设施的运营，包括水质监测。
第三方权威环境检测公司：
具有CMA资质，可以提供专业的水质检测服务。
建议根据具体需求和实际情况选择合适的部门进行水质检测，以确保检测结果的准确性和可靠性。