化验水质的部门有以下几种选择：
卫生防疫部门：
如果怀疑水源被病原污染（如寄生虫、痢疾），可以找防疫站进行检验。他们负责检查病原体等，确保水质安全。
环境监测部门：
需要检查水源中所含元素、化合物等是否符合饮用水指标，应找环保部门。环保部门会检测水中的大肠杆菌等指标，并出具相关报告。
药检所：
药检所也可以进行水质检测，特别是涉及药品和医疗器械相关的水质问题。
质监局：
水厂出来的水，可以找质监局进行检测。质监局有专门的实验室，可以检测各种物质，包括饮用水。
自来水公司或自来水检测中心：
这些机构通常对进出厂水进行检验和监控，确保自来水质量符合标准。
疾控中心：
疾控中心承担传染病预防、流行病学调查等工作，也可以进行饮用水水质检测。他们通过采集水样，化验其中是否存在细菌、病毒等病原体。
卫生监督部门：
负责监督和管理饮用水卫生安全，具备相关的专业知识和技术，能够对饮用水进行全面的化验和检测。
建议根据具体需求和水质情况，选择合适的部门进行化验。例如，如果怀疑水源受到病原体污染，应优先选择卫生防疫部门或疾控中心；如果需要检测饮用水是否符合国家标准，可以选择质监局或自来水公司。