家兔养殖中的消毒工作对于预防疾病和保持兔舍卫生至关重要。以下是一些推荐的消毒方法：
进场进舍消毒
进入场区的人员和车辆必须严格消毒后才能进入。
出售家兔必须在场区外进行，已调出的家兔不能再送回兔场。
严禁其他畜禽进入场区。
场区和环境消毒
每隔3~5天对兔舍周围清扫1次，每隔10~15天消毒1次。
晒料场和兔运动场每日清扫1次，每隔5~7天消毒1次。
每年春、秋两季，在兔舍墙壁上和固定兔笼的墙壁上涂抹10%~20%的生石灰乳，墙角、底层笼阴暗潮湿处应撒上生石灰。
生产区门口、兔舍门口、固定兔笼出入口的消毒池，每隔1~3天清洗1次，并用2%的热碱水溶液消毒。
设备及用具消毒
兔舍、兔笼、通道、粪尿底沟每日清扫1次，夏、秋季节每隔3~5天消毒1次。
粪便和脏物应选择离兔场150米以外的地方堆积发酵后掩埋。
在消毒的同时，有针对性地用0.5%~1.0%的敌百虫水溶液喷洒兔舍、兔笼和周围环境，以杀灭螨虫和其他有害昆虫，同时应做好灭鼠工作。
兔舍的设备、工具应固定，不互相借用；兔笼的料槽、饮水器和草架也应该固定，用具用完后及时消毒。
产仔箱、运输笼等用完后要冲刷干净并消毒后备用；家兔转群或母兔分娩前，兔舍、兔笼均须消毒1次。
养兔所用的水槽、料槽、料盆、运料车等工具每日都应该进行冲刷，每隔5~7天用沸水或2%的热碱水溶液消毒1次。
治疗兔病所用的注射器、针头、镊子等器具每次使用后在沸水中煮30分钟或者用0.1%的新洁尔灭浸泡消毒。
带兔消毒
在兔舍内饲养兔只情况下，使用对家兔刺激性小的消毒药物合理配比后，利用一定压力将其均匀喷洒在舍内空间之中，起到消毒降尘、预防疾病的作用。
消毒前准备：带兔消毒要在清粪、打扫卫生之后，减少环境中的污物可发挥更好的消毒效果。
消毒液的配制：消毒药的用量按使用说明的推荐浓度与用水量计算，用水量根据兔舍的空间大小估算，一般每立方米兔舍需要50-100mL，不同季节，消毒用水量应灵活掌握，在天气温暖时用量应偏大，计算按标准的上限；天气寒冷、保暖差时用量偏少，按标准的下限计算。
消毒顺序：一般按照从上至下，即先房梁、墙壁再笼架最后地面的顺序；从后往前，即从兔舍由里向外的顺序，如果采用纵向机械通风，前后顺序则相反，应从进风口向排风口顺着空气流动的方向消毒。对通风口与通风死角的消毒务必要严格彻底，这是阻断传播途径的关键部位。
消毒时间：消毒最好选在每天中午的11:00-14:00左右进行，此时气温比较高一些，比较适合消毒。根据舍温，消毒时间可长可短，兔舍温高时，放慢消毒速度、延长消毒时间可起到防暑降温作用；兔舍温低时，加快消毒速度、缩短消毒时间可减小对家兔的冷应激。
消毒方法：消毒枪应在兔只的上方约50cm处均匀喷洒，消毒液呈雾状均匀落在笼具、兔的体表和地面，使兔的兔毛微湿。同时喷洒、冲洗房梁与通风口处，不可以直接对兔体喷射。消毒后应增加通风，以降低湿度，特别在闷热的夏季更有必要。
消毒频率：家兔舍每天用。
物理消毒法
包括机械性清除、日光曝晒、紫外线灯照射、煮沸消毒和火焰消毒。
兔舍内的消毒，包括兔舍地面、墙壁、项棚和空气的消毒，以及兔笼、水槽和产仔箱的消毒。对于不同地点及用具，应采取不同的消毒方法