纯净水常用的消毒方法包括以下几种：
紫外线消毒：
紫外线杀菌消毒是利用适当波长的紫外线能够破坏微生物机体细胞中的DNA或RNA的分子结构，造成生长性细胞死亡和（或）再生性细胞死亡，达到杀菌消毒的效果。紫外线消毒技术具有无持续杀菌能力、不添加任何化学物质、消毒效果好及不产生消毒副产物等优点。
臭氧消毒：
臭氧杀菌能够杀灭病毒、真菌、芽孢、肉毒杆菌毒素等，通过氧化作用破坏了微生物膜的结构实现了杀菌效果。臭氧消毒的优点在于它能高速和高效地杀灭病菌和病毒，消除囊孢，并且臭氧分解后的产物是氧，较为安全。
化学消毒：
通常使用次氯酸钠等消毒剂，通过氯与水中的有机物反应，产生一系列氯的副产物。虽然氯消毒具有处理水量较大、单位水体处理费用较低、具有持续消毒能力等优点，但存在一定的安全问题，如产生有毒的卤代烃等副产物。
加热法：
通过加热至一定温度并保持一段时间，使水中的微生物失去活性。这种方法适用于少量水的处理，但对于大量水体灭菌成本较高。
过滤法：
通过砂滤、石棉滤板、纤维酯滤膜等过滤介质去除水中的微生物。这种方法只能除菌而不是杀菌，因此通常与其他消毒方法结合使用。
在实际应用中，纯净水生产过程中常采用紫外线消毒和臭氧消毒相结合的方式，以确保水质的安全和卫生。同时，还需要定期对生产全程的管道、容器和过滤器等相关设施进行清理和消毒，防止微生物污染。
建议：
选择合适的消毒方法：根据具体水质和处理要求，选择适宜的消毒方法，确保消毒效果的同时，尽可能减少消毒副产物的产生。
定期维护和清洗：对消毒设备进行定期维护和清洗，确保其正常运行和消毒效果。
综合控制：控制纯净水微生物污染应采取综合性措施，包括加强自身卫生管理、合理设计生产流程、选择合适的消毒设备等，确保产品质量。