养殖手续的补办流程如下：
未批先建养殖场补办手续
前往建委的监察大队办理罚款手续，并按照要求缴纳罚款。
罚款完成后，前往标办进行合同备案，以获取合同备案号。
核实养殖场的建设是否符合村镇建设规划，若符合，则需到村镇站办理建设用地规划许可证。
在取得建设用地规划许可证后，到国土部门补办用地手续。
畜牧养殖证丢失补办
需要去当地畜牧局补办，工作日去办理。
办理特种养殖证需要以下材料：
资金证明
场地合法证明
饲料来源
防疫设施
办场人身份证明
合法来源的驯养繁殖证原件或复印件
具有畜牧技术员以上职称2人以上，畜牧师以上职称4人以上，资格证原件和复印件。
持以上材料去所在县级林业部门填写相关许可证表格，由县级林业部门审查盖章后，报市林业局，市林业局审查盖章后报省林业厅办理。
一般养殖场补办手续
咨询当地畜牧局或环保局了解具体流程和所需材料，确保手续齐全合法经营。
可以考虑聘请专业法律顾问协助处理。
建议：
补办养殖手续时，应先了解当地的具体政策和要求，确保所有材料和流程符合法规。
尽早补办相关手续，避免因手续不全而面临不必要的法律风险和经济损失。
如果养殖场的建设不符合村镇建设规划，可能需要重新规划和建设，以符合法规要求。