处理养殖占地的方法如下：
规划用地
养殖用地必须事先经过国土部门的统一规划，确保不占用基本农田，尽量选择劣地和荒地。
申请与备案
个人申请养殖项目，经村镇同意后，到畜牧部门办理规模化养殖备案手续。
携带个人申请、村镇证明、养殖备案手续到国土所申请办理养殖用地备案手续，国土所进行现场测量，出具相关证明，并签订土地复耕协议书，确保不改变用途且停养后及时复耕。
农用地转用审批
如果养殖用地需要建设永久性建筑且不能恢复耕种，应当办理农用地转为建设用地的审批手续，须缴纳有偿使用费和造地费。
禁止擅自改变用途
办理养殖备案手续后，不得将养殖用地改作他用。停止养殖后必须及时复耕，否则将按照违法占地处理，可能面临拆除和罚款的处罚。
违法占地处理
对于违法占地的养殖场，最有效的处理方法是向土地管理部门举报。土地管理机关将进行调查，若发现违法情节，将责令养殖场终止违法行为，拆除非法建筑，恢复土地原貌，并可能处以罚款。
法律责任
未经批准或采取欺骗手段骗取批准非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除非法建筑，恢复土地原状，并可能处以罚款。对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分。
整改与处罚
若违规行为轻微，可能需责令其限期整改，按原样修复土地，并处以罚金。若行为严重，则可能导致养殖场所属建筑物被强制拆除，所占土地被收回，相关责任人需承担法律责任。
尊重承包人自主权
养殖用地属于农业用地，其上建造养殖用房不属于改变土地用途的行为。在不破坏耕地的耕作层和不占用基本农田的前提下，土地承包人可以自主决定将耕地用于养殖业。
建议：
养殖场在选址和建设过程中应严格遵守相关法律法规，确保合法合规。
对于已经存在的违法占地情况，应尽早向相关部门举报，以便及时依法处理。
养殖场应积极配合土地管理部门的调查和处理，承担相应的法律责任，并确保及时复耕，避免进一步的法律后果。