林地养殖的处理方式主要依据《中华人民共和国土地管理法》和《中华人民共和国森林法实施条例》等相关法律法规。以下是具体的处理步骤和注意事项：
占用林地修建养殖场的处罚
如果占用林地修建养殖场是永久性建筑且未经审批，则会被责令拆除，并限期恢复林地原状。
根据林地的破坏程度，可能会被处以适度的罚款。
非法占用农用地，改变土地用途，数量较大，造成大量毁坏的，将负刑事责任，可处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。
占用林地的审批手续
养殖用地占用林地的，应当办理农用地转用审批手续。
审批流程一般包括先由畜牧主管部门办理项目备案手续，再到国土资源部门办理用地备案手续，经审核同意的予以用地备案。
涉及永久基本农田转为建设用地的，需由国务院批准；其他农用地转为建设用地的，按土地利用年度计划分批次报批。
历史遗留问题的处理
对于违法占用林地的养殖场，应根据不同情况采取不同的处理措施。对于历史沿革较长且在法律法规出台前的违法行为，应充分考虑当时实际情况，妥善处理；对于法律法规出台后的违法行为，则严格按照法律规定进行处罚。
合法化手续
对于依法履行处罚程序后，符合用地审批条件的养殖场，可依法依规办理相关用地手续。
建议：
养殖用地占用林地的，必须严格遵守相关法律法规，办理完备的审批手续，避免因违法行为而受到处罚。
对于历史遗留问题，应积极与当地政府和相关部门沟通，寻求合法合规的解决方案。