公积金贷款的扣款方式主要有以下几种：
支取划付业务
如果贷款同时办理了支取划付业务，第一个月需要自行存入还款额以保证扣款。
从第二个月起，每月的固定日期（如每月3日，遇节假日顺延），公积金管理中心会自动划付至上借款人的公积金联名卡中。
如果借款人的公积金账户余额不足，系统会尝试划付其配偶的公积金账户（如已办理相关手续），直至还款额全部划付完毕。
如有逾期，则停止划付，并可能产生罚息等后果。
优点：自动划付，方便快捷，减少了借款人每月手动还款的麻烦。
按月支取划付与自行还款结合
公积金贷款还款与按月支取划付是两种不同的业务。
办理了住房公积金贷款后，按月还款是借款人的义务。
借款人可以选择办理按月支取划付业务，但这并不意味着可以完全依赖公积金账户自动还款。
需要明确的是，即使办理了按月支取划付业务，借款人仍需在还款日前确保账户中有足够的余额以偿还贷款。
自动扣款
公积金贷款的还款日，系统通常会自动从借款人的指定账户中扣除当期应还款金额。
如果账户余额不足，系统会采取补救措施，继续发起第二次甚至更多次扣款。
还款日当天多次扣款的机制：第一次自动扣款安排在上午，第二次扣款则在下午进行，某些情况下，系统甚至可能会在晚上发起第三次扣款。
自动扣款的补扣机制：如果首次自动扣款失败，系统会在当天的不同时间段再次尝试扣款，直到累计达到本期应还款金额为止。
扣款顺序与优先级
配偶双方共同申请贷款的扣款顺序：系统会优先从主贷人的还款账户中扣款，如果主贷人的账户余额不足，则会从次贷人的账户中发起扣款。
公积金对冲还款业务的扣款顺序：如果借款人选择了公积金对冲还款业务，扣款的顺序会有所不同，通常会优先使用公积金余额还款，余额不足时再从指定银行卡内进行扣费。
提取公积金账户的钱还款
还款期间，借款人可以从公积金账户提取资金还房贷。
比如，贷款人每年可以从公积金里面提取一次，用来提前还房贷。
公积金冲还贷分为年冲和月冲两种方式，年冲是每年办理一次部分提前还款，优先偿还公积金贷款本金，每月的月还款必须自行使用现金归还；月冲则是每月自动从公积金账户提取资金还贷。
建议
提前规划：借款人应提前规划好公积金的存入时间，确保在还款日前账户余额充足，避免因余额不足导致扣款失败。
了解业务：借款人应详细了解公积金贷款的各项业务规则，包括支取划付业务、按月支取划付业务以及公积金对冲还款业务，以便选择最适合自己的还款方式。
关注通知：建议借款人开通还款银行卡的短信通知服务，以便及时了解公积金的存入和划出情况，确保按时还款。