处理员工擅自离岗的情况，用人单位应遵循以下步骤和措施：
书面通知
向员工发出书面通知，要求其在规定期限内返回工作岗位。
通知应明确指出员工违反劳动纪律和劳动合同的具体情况。
送达辞职通知
如果员工在规定期限内未返回工作岗位，且其行为符合辞退标准，用人单位应以书面形式送达辞职通知。
辞职通知应要求员工前来办理交接和离职手续。
工资支付与出勤结算
员工擅自离岗导致工作时间缺失，用人单位可以相应减少工资支付。
工资支付应依据员工的实际出勤情况来确定。
赔偿责任
如果员工的行为给单位造成了经济损失，用人单位可以要求员工承担相应的赔偿责任。
赔偿比例通常不超过员工当月工资的20%，但不得低于当地月最低工资标准。
法律程序
劳动者应遵循法律程序办理离职手续，以维护自身权益。
如遇争议，用人单位可提供送达证明，如挂号信回执或EMS邮寄记录。
其他措施
对于造成严重影响工作或企业财产损失的行为，用人单位可给予记过、记大过、降级、撤职，甚至开除等处分，并可能追究刑事责任。
处理过程中，用人单位应确保所有措施合法合规，并保存好相关证据