在离婚案件中，有两个男孩的抚养权判决通常遵循以下原则：
双方协商一致：
如果夫妻双方在离婚时能够就孩子的抚养权达成一致意见，法院通常会尊重双方的意愿，并按照双方的协议出具判决书。
一人抚养一个：
如果双方无法就孩子的抚养权达成一致意见，法院通常会判决一方抚养一个孩子。这种判决方式在司法实践中较为常见，尤其是当孩子年龄较大时。
年龄因素：
法院在判决时会考虑孩子的年龄，通常两周岁以下的子女原则上随母亲生活，两周岁到十周岁之间的子女会根据哪一方更有利于子女的成长进行判决，而十周岁以上的子女则可以征求孩子的意见。
抚养能力和条件：
法院在判决时会综合考虑夫妻双方的抚养能力和抚养条件，包括经济能力、居住环境、教育条件等，以确保孩子的最佳利益得到保障。
孩子的意愿：
对于十周岁以上的子女，法院会尊重其意愿，听取他们对抚养权归属的意见。
特殊情况：
如果一方存在特殊情况，如患有严重疾病、无法履行抚养义务等，法院可能会将抚养权判给另一方。
建议
在离婚涉及两个男孩的情况下，建议夫妻双方尽量通过协商达成一致意见，以减少对孩子的伤害。如果协商无果，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径争取孩子的抚养权，并确保孩子的最佳利益得到保障。