蝇蛆养殖中的灭菌方法包括以下几种：
微波干燥杀菌消毒
使用微波干燥技术对蝇蛆养殖环境进行杀菌消毒，确保养殖环境的无菌状态。
春新益生菌稀释液喷雾
每天上午10点使用50倍的春新益生菌稀释液对蛆房的所有地方进行喷雾，以消除臭味和灭菌。
环丙氨嗪
使用环丙氨嗪，这是一种国家批准使用的专杀蝇蛆的药物，对畜禽无害，对人体无害，能降低圈舍内氨气含量，改善饲养环境。
干燥环境
发现蛆后，立即停止浇水，使蛆在干燥环境下自然死亡，并将花盆放在阳光下暴晒。
化学肥料
使用磷酸二氢钾、过磷酸钙、尿素或复合肥溶液浇水，以达到灭蛆的目的。
草灰或热灰
在粪面上撒上草灰或热灰，阻断空气来源，从而杀死蛆。
堆肥
将蛆捞出喂鸡鸭，或通过堆肥产生的热气和有害气体将里面的蛆杀死。
生石灰
在半腐熟的人粪尿中加入1%-2%的生石灰，使氮素损失15%左右，达到灭蛆的目的。
马拉硫磷
在蝇蛆滋生地按每平方米500毫升喷洒0.2%的马拉硫磷等药物杀灭蝇蛆。
物理隔离
铲除蝇蛆孳生地，如改建卫生厕所，清除连茅圈、旱厕，及时清除生活环境中的垃圾及腐败动物尸体。
这些方法可以根据具体情况和实际需求选择使用，以确保蝇蛆养殖过程的无菌和健康。