如果您发现有人非法养殖扇贝，可以向以下部门举报：
当地国土局：
负责土地管理和监督工作，非法养殖可能涉及土地使用问题。
当地农业局：
负责畜牧业管理和动物防疫等工作，非法养殖可能违反动物防疫条件。
当地环保局：
负责环境保护和污染防治等工作，非法养殖可能严重污染环境。
具体举报方式可以是电话、信函、电子邮件或亲自前往相关部门进行投诉。在举报时，请提供尽可能详细的养殖地点、养殖规模、违反的具体规定等信息，以便相关部门能够及时调查处理。
此外，如果养殖行为违反了《动物防疫条件审查办法》和《畜禽规模养殖污染防治条例》等相关法规，您还可以向当地农业部门和环保部门进行投诉，由相关部门依法进行调查处理，并可能采取责令限期治理、罚款等措施。