港澳通行证的挂失流程如下：
报警
拨打香港和澳门的报警电话999进行报警。
在澳门，还需持“报警回执”到澳门警察局出入境事务厅申请办理报失通知书。
挂失与补办
当事人凭警方出具的“证件遗失报警回执”向香港或澳门的“中国旅行社”申请一次性有效的《出入境通行证》。
提交申请表、2张照片（免冠）、身份证明材料。
如果证件办理原因是逗留，可以向香港出入境事务处办理逗留延期备案手续。
领取新证件
按照取证时间和回执到指定地点领取一次性《出入境通行证》，然后回到大陆。
建议在丢失港澳通行证后尽快报警并获得报警回执，然后及时联系香港或澳门的中国旅行社办理补办手续，以确保能够顺利往返大陆和港澳地区。