日本扇贝的养殖方法主要包括以下几个步骤：
海区选择与养殖设施
底质：选择平坦的泥底或沙泥底，较硬底质的沙底次之，稀软泥底也可以考虑，但凹凸不平的岩礁海底不适合。
养殖设施：利用筒身前后的扣鼻吊挂在浮埂上，3~5筒连成一组，筒顺流平挂于1~5m的水层中，每桶可放养幼贝数百个。
人工育苗
育苗标准：贝壳高大于5厘米，壳厚大于2厘米的扇贝。
筛选与消毒：淘汰壳上有附着物的扇贝、死掉和腐坏的扇贝，保证健康扇贝作为苗种。
育苗用水消毒：使用紫外线或臭氧对育苗用水进行消毒，也可以添加杀菌消毒药物进行深度处理。
黏着养殖
黏着剂：使用无毒环氧树脂作为黏着剂。
基质：用直径2~3cm的棕绳、胶带、聚乙烯绳或聚丙烯绳做黏着基质。
操作：将壳高2~3cm的苗种一个个黏着在基质上，注意足丝孔向着附着基质，壳顶韧带腹面朝下。
饲料与饲养环境
饲料选择：使用扇贝专用饲料，也可以自制饲料，搭配其他营养成分，去掉劣质和带病毒的饲料。
水质管理：保证水质干净卫生，定期消毒，使用无害药剂改善水质，定期清理养殖设备。
温度控制：养殖水温控制在10-15℃左右，水温变化不超过3℃。
养殖密度：每层养殖网笼中最多100粒扇贝，根据生长状况分群饲养。
养成期间管理
分苗与倒笼：不同季节适时调节养殖水层，及时分苗与倒笼。
清除附着生物：定期清除网笼上的附着生物，保持水流畅通。
检查与维护：养殖后期增加浮力，检查浮漂、吊绳、网笼等是否正常，发现问题及时解决。
贝藻间养或轮养
贝藻间养：在养殖过程中可以搭配其他贝类或藻类，以提高养殖效益和减少病害。
通过以上步骤，可以有效地进行日本扇贝的养殖。在整个养殖过程中，水质管理、温度控制和饲料选择是非常关键的环节，需要特别注意。