清洁孔洞结构石材的方法如下：
成品保护
使用成品保护膜、保温棉等材料对施工区域进行保护，防止污染和损坏成品。
防护处理
采用专业的石材防护剂对石材进行规范和有效的治疗，减少石材病症的发生，防止水分渗透到石材内部。
石材表面清洁
使用专用石材清洗剂和研磨刷清洗石材孔洞、缝隙、破碎处的污垢。将药物充分涂刷到板面孔洞中，等待30分钟，让其与孔洞中的污渍进行化学反应，然后用吸尘器吸干净表面析出物。对孔洞进行2-3次处理，直至彻底清除孔洞内污垢。
石材表面修复
待石材清洁干燥后，对较大的孔洞、裂缝用云石胶进行修补。根据石材的颜色选择相应颜色的云石胶进行调色，填充，先填充大孔，再填充小孔。修补孔洞时，胶体应鼓出石材表面，确保石材整体美观和石材裂缝之间的牢固度，保持结晶后整体光泽度一致。
填缝胶填充
修复之前，首先需要将孔洞的表面清洁干净，去除灰尘和杂质。然后，将填充胶均匀地涂在孔洞的表面，填补孔洞。填充之后，用刮刀等工具将表面刮平，并使其与周围的石材表面平齐。最后，等待填充胶完全干燥后，可进行打磨和抛光的处理，使修复部位与原石材表面无明显差异。
晾干
在阳光充足的地区，可以让洞石自然风干。而在其他地区，则需要手动擦干，以避免水珠和水渍的形成。
通过以上步骤，可以有效地清洁和修复孔洞结构石材，保持其美观和耐用性。建议在实际清洁和修复过程中，严格按照上述流程操作，并根据具体情况调整具体步骤。