申请养殖小龙虾需要遵循以下步骤：
单位或个人提出申请，并准备相关材料。
提交材料，包括养殖使用证申请表、水域滩涂开发使用情况证明材料、水域滩涂界至图等。
受理人员审核，并由主管部门组织人员现场勘查确认标界。
主管部门填写养殖使用权审批表。
符合条件者将发放养殖许可证，不符合条件者将出具退办通知书。
此外，还需注意以下事项：
开展小龙虾养殖属于水产养殖，需要办理《水域滩涂养殖使用证》（简称水产养殖证）和《工商营业执照》。
水产养殖证的办理手续包括向县级（包括县级）以上渔业行政主管部门提出申请，经调查审定，报同级人民政府核准，登记注册。办理时需携带水面承包合同（合同要有乡、村公章和负责人签字）。
如果利用农村的荒塘和荒田进行养殖，还需先到自然资源局办理土地相关手续，因为国家有十八亿亩耕地红线，以及土壤的耕作层不能受到破坏等相关规定。
在自然资源局取得合法手续后，农业农村局负责办理水域滩涂养殖证，后续扩建与前期新建的程序相同。
建议在申请过程中，先咨询当地相关部门，了解详细的申请要求和流程，以确保申请的顺利进行。