养殖菌种的使用方法根据不同的养殖对象和需求有所不同。以下是一些常见的使用方法：
在肉兔养殖中的使用方法
添加到日粮中：将养殖菌种粉剂原种培育成菌液，用水稀释后与肉兔日粮充分混匀，直接投料饲喂。
添加到饮水中：将水与养殖菌种菌液按1:200的比例添加混合，直接添加水槽，让肉兔自由饮水。
除臭降氨：将养殖菌种菌液和水按1:50的比例稀释，均匀喷洒在兔舍、幼兔运动场及粪尿沟等，以灭病原微生物或抑制其生长繁殖。
在水产养殖中的使用方法
光合菌：夏季使用光合菌可以脱硫降氨氮，分解小分子有机质，净化水质，抑制有害菌和有害藻类的生长，提高水产养殖动物的免疫力。
EM菌：包含多种有益菌，主要用于稳水，提高苗种成活率，辅助肥水、发酵、粪肥、造化饲料等，改善水质，稳定水质，促进鱼虾蟹的生长。
乳酸菌：属于厌氧菌，不耗氧，可以分解小分子有机物，降低水体酸碱度，稳定PH值，提高消化酶活性，抑制有害藻类生长。
芽孢杆菌：分解水体中的大分子有机质，转化成小分子无机盐，起到净水作用，为藻类和水草提供养分，配合改水产品消除池塘内的不良水色。
在农业种植中的使用方法
食用菌种植：将菌种与培养料混合后播种，注意温度和湿度管理，定期喷水保持土壤含水量，促进菌丝生长和菇蕾形成。
使用注意事项
菌种选择：选择适合养殖对象和环境条件的菌种，确保菌种的纯度和活性。
使用剂量：根据养殖对象和菌种类型，选择合适的剂量和使用频率。
保存条件：未使用的菌种应妥善保存，避免阳光直射和高温环境，确保菌种的活力。
混合使用：多种菌种配合使用，可以产生协同效应，提高使用效果。
通过以上方法，可以有效地利用养殖菌种，促进养殖对象的生长和健康，同时改善养殖环境，提高养殖效益。