制药工程专业的毕业生有多种职业选择，主要包括：
制药生产与质量控制：
在制药企业从事药品生产、生产工艺优化、质量控制、药品质量检验等工作。
制药工艺与设备研发：
参与新药物制造技术的开发、现有药物生产工艺的改进以及制药设备的设计。
药物研发与创新：
从事药物分子设计、合成、药效评价，参与新药研发项目。
药品注册与监管：
参与药品上市前的审评、监督，确保药品符合法规要求。
药物营销与客户服务：
负责药品市场推广、销售管理，提供药品使用指导和售后服务。
继续深造：
报考研究生或出国深造，深入研究制药领域的前沿技术和学术问题。
其他领域：
包括医疗器械、生物技术公司、医药销售等领域。
制药工程专业的毕业生通常具备化学制药、生物制药、中药制药、药物制剂技术与工程的基本理论知识和技能，能够在制药及其相关领域的生产企业、科研院所、设计院和管理部门等单位从事产品开发、工程设计、生产技术与质量管理和科技服务等工作。