去普陀山坐船的主要码头有以下几个：
朱家尖蜈蚣峙码头：
这是去普陀山最方便、最近且最快的码头。码头造型特别，靠近机场，很多游客都会选择从这里出发。
沈家门半升洞码头：
这个码头也在常用选择之列，尤其是当朱家尖蜈蚣峙码头正在进行维修改造时。
吴淞客运码头：
位于上海的宝山区，有快艇和慢船两种选择。快艇从南浦大桥下去买票，慢船则需要在吴淞客运码头乘坐。
芦潮港码头：
位于上海的南汇区，游客可以乘坐01路公交车到浦东南路宁阳路站下，然后换乘塘彭芦线到芦潮港码头站下。
公平路码头：
位于上海的公平路，游客可以乘坐37路、929路、13路、875路、134路等公交车到公平路码头，然后坐船去普陀山。
十六铺码头：
位于上海的十六铺，需要乘坐一个晚上的船才能到达普陀山。
建议
从上海出发：推荐选择南浦大桥的旅游集散中心或公平路码头，因为这两个地方有直达普陀山的快艇服务，且班次较多，交通较为便利。
从宁波出发：可以先到宁波的白峰码头坐轮渡到沈家门码头，再坐船到普陀山。
从杭州出发：可以先到杭州东站坐大巴到舟山普陀客运中心，然后到沈家门半升洞码头或朱家尖蜈蚣峙码头坐船。
根据以上信息，如果时间允许且追求速度，建议选择朱家尖蜈蚣峙码头；如果在上海，公平路码头和吴淞客运码头都是不错的选择。