在日本停留的时间取决于您所申请的签证类型和入境目的。以下是一些常见签证类型及其允许的停留期限：
团队签证
一次有效，最长停留15天。
个人旅游签证
单次有效，最长停留15天。
三年多次个人旅游签证，三年内无限次可以去日本，每次停留时间最长30天。
五年多次签证，五年内无限次可以去日本，每次停留时间最长90天。
商务签证
根据具体情况，一般允许停留90天，不可延长。
探亲访友签证
根据具体情况，一般允许停留90天，不可延长。
工作签证
持有日本工作签证且有企业雇佣的情况下，可以一直在日本工作和居住。签证时间由日本入管局根据材料随机批复，分为一年、三年、五年，并在满足一定条件后可以申请入籍或永住。
过境签证
在日停留不超过72小时，不出机场，有前往国家签证且持有订妥机座联程机票者，免办过境签证。否则需要申办过境签证，停留时间为3至4天。
研修签证
根据日本出入国管理以及难民认定法的规定，具有居日"研修"资格者，必须遵守规定的居留期限，居留期限一般为1年、6个月或3个月。
建议
短期停留：如果您是第一次访问日本，建议选择团队旅游签证或个人旅游签证，停留时间通常为15天。
中长期停留：如果您计划在日本停留较长时间，例如探亲访友或商务工作，可以考虑申请三年多次个人旅游签证或五年多次签证，每次停留时间最长90天。
长期居住：如果您打算在日本长期居住和工作，可以申请工作签证，并在满足一定条件后申请入籍或永住。
请根据您的具体需求和计划选择合适的签证类型，并确保遵守相关规定。