南通到南京的汽车行程时间如下：
乘坐汽车
从南通长途汽车站到南京中央门车站坐客车需要3.5小时，如果堵车则可能需要4.5小时。
其他信息表明，南通到南京的大巴车行程时间约为3.5小时。
自驾
从南通开车到南京的总行程为264.2公里，开车时间需要2小时41分钟，油费约167元，过路费约145元。
另一条自驾路线显示，总距离为257.53公里，总耗时3.1小时，油费155元，路桥费115元。
乘坐火车
从南通到南京乘坐城际铁路列车大约需要2个半小时左右。
综合以上信息，南通到南京的汽车行程时间约为3.5小时左右，具体时间可能会因路况和交通状况有所变化。建议提前规划行程并确认交通方式，以确保顺利到达目的地。