杭州站和杭州东站的主要区别如下：
位置不同
杭州站，也称城站，位于杭州市下城区环城东路1号。
杭州东站位于杭州市江干区天城路1号。
车站性质不同
杭州站是一座客货站，同时运营高铁和普速列车。
杭州东站则是一座高铁站，主要运营高铁列车，并且是一个重要的交通枢纽和中转站，连接多条高铁线路。
成立时间不同
杭州站始建于1906年11月14日，是杭州最早建成的火车站之一，经历了多次重建和迁址，1999年12月28日第三次重建后正式投入使用。
杭州东站始建于1992年4月1日，2008年12月27日进行了改扩建，2013年7月1日正式启用。
主要运营线路不同
杭州站主要承担普快列车和部分动车组的运营。
杭州东站则主要承担高铁列车的运营，包括沪杭高铁、宁杭高铁、商合杭高铁、杭甬高铁、杭长高铁、杭黄客运专线、杭福深客运专线等多条线路的始发和到达。
交通枢纽功能
杭州东站是杭州市的东大门，接驳功能齐全，不仅是高铁枢纽站，还是城市快速公交系统、轨道交通和各类车辆等多种交通方式的集散地，日输送旅客量可达50万人次。
杭州站虽然也是交通枢纽，但相比之下，接驳功能没有杭州东站那么齐全。
总结：
杭州站和杭州东站虽然都是杭州市的铁路客运站，但它们在地理位置、车站性质、成立时间、主要运营线路以及交通枢纽功能等方面存在明显的区别。杭州东站主要承担高铁列车的运营，并且是一个重要的交通枢纽和中转站，而杭州站则同时运营高铁和普速列车，历史更为悠久，主要承担普快列车和部分动车组的运营。