季度奖金的扣税方法通常是将季度奖金并入当月的工资薪金所得中，一起计算个人所得税。具体步骤如下：
1. 将季度奖金与当月工资薪金合并计算，确定适用的税率。
2. 根据合并后的总收入减去起征点（如基本免税额）、专项扣除、专项附加扣除等，计算出应纳税所得额。
3. 应用适用的税率和速算扣除数计算应纳税额。
例如，假设某员工季度奖金为1万元，当月工资为5000元，起征点为5000元，适用税率为20%，则计算过程如下：
应纳税所得额 = （季度奖金 + 当月工资 - 起征点）= （10000 + 5000 - 5000）= 10000元
应纳个人所得税 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数 = 10000 × 20% - 1410 = 1445元
请注意，如果选择使用“全年一次性奖金”的单独计税方式，则季度奖金需要单独计算个税，不并入工资计税。但请注意，全年一次性奖金的单独计税方式一年只能使用一次。