政府投资的三本大学包括以下几所：
北京师范大学珠海分校：
由珠海市政府出资建设。
浙江大学宁波理工学院：
由宁波市政府出资建设。
首都师范大学科德学院：
位于北京，但具体政府投资情况未详细说明。
山西财经大学华商学院：
位于山西，但具体政府投资情况未详细说明。
沈阳大学科技工程学院：
位于辽宁，但具体政府投资情况未详细说明。
上海外国语大学贤达经济人文学院：
位于上海，但具体政府投资情况未详细说明。
南昌大学科学技术学院：
位于江西，但具体政府投资情况未详细说明。
吉林大学珠海学院：
由吉林大学与珠海市华政教育投资有限公司合作建设，位于广东。
云南师范大学商学院：
位于云南。
四川大学锦江学院：
位于四川。
武汉科技大学城市学院：
位于湖北。
燕山大学里仁学院：
位于河北。
华南理工大学广州学院：
位于广东。
同济大学浙江学院：
位于浙江。
南京大学金陵学院：
位于江苏。
中山大学南方学院：
位于广东。
建议：
北京师范大学珠海分校和 浙江大学宁波理工学院是明确由地方政府出资建设的三本大学。
其他大学虽然列在三本大学名单中，但具体政府投资情况未详细说明，可能需要进一步核实。