上海三所知名的三本大学及其推荐专业如下：
上海应用技术大学
香料香精技术与工程
软件工程（卓越工程师计划试点班）
材料科学与工程（卓越工程师计划试点班）
上海工程技术大学
机械工程
车辆工程
计算机科学与技术
航空运输学院（与东航、吉祥航空等航空公司合作）
上海财经大学
应用经济学
工商管理
理论经济学
统计学
管理科学与工程
公共管理
法学
马克思主义理论
数据科学与大数据技术
工程管理
信息管理与信息系统
这些专业均具有较高的教学水平和行业认可度，建议根据自己的兴趣和职业规划选择适合的专业。同时，建议查询相关学校和专业官网，以获取更准确的信息。