机械设计制造及其自动化专业的一本大学包括：
1. 清华大学
2. 哈尔滨工业大学
3. 上海交通大学
4. 华中科技大学
5. 北京理工大学
6. 大连理工大学
7. 天津大学
8. 西安交通大学
9. 浙江大学
10. 湖南大学
11. 中南大学
12. 国防科技大学
13. 重庆大学
14. 华南理工大学
15. 北京航空航天大学
16. 南京航空航天大学
17. 同济大学
18. 吉林大学
19. 燕山大学
20. 山东大学
21. 西北工业大学
这些大学在机械工程领域的教学和研究水平均属于国内顶尖，建议优先考虑这些学校。
对于三本大学，以下是一些建议：
1. 河南理工大学万方科技学院
2. 燕山大学里仁学院
这些学校在机械设计制造及其自动化专业方面也有一定的教学实力，可以作为备选方案。
建议：
一本大学：优先考虑清华大学、哈尔滨工业大学等顶尖高校，这些学校在机械设计制造及其自动化专业方面具有很高的声誉和实力。
三本大学：可以考虑河南理工大学万方科技学院和燕山大学里仁学院，这些学校在机械设计制造及其自动化专业方面也有一定的教学实力，且综合星级和排名较高。