合肥三本大学考研的专业选择相对多样，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。以下是一些推荐的专业：
医学类专业：
医学类专业由于扩招，毕业生人数逐年攀升，但就业形势依然较好。尤其是二三本大学的医学专业毕业生，考研是提升就业竞争力和薪资水平的有效途径。
教育学：
教育学专业的竞争压力相对较小，适合跨考和在职考研的人员。
法硕（非法学）：
该专业考试方式为全国统考，科目较少，试题相对简单，且招收人数多，公平性较高。
人文类专业：
如历史学、考古学、文学、美学、哲学等，这些专业需要扎实的理论基础，就业方向多在文化单位。
金融、市场营销、国际贸易实务：
这些专业与国贸相关，就业前景较好，适合本科为国际经济与贸易的学生。
仪器科学与技术、生物医学工程、仪器仪表工程：
这些专业在合肥工业大学有招生，且就业前景较好。
机械类、动力工程、工业工程与管理：
这些专业在合肥工业大学也有招生，适合对机械和工程领域感兴趣的学生。
建议根据个人兴趣和职业规划，选择适合自己的专业进行报考。同时，可以关注目标院校的研究生招生专业目录，了解具体的招生要求和考试科目，以便更好地准备考研。