截至2024年，武夷学院设有多个学院，包括：
海外教育学院
体育教学部
继续教育学院
马克思主义学院
玉山健康管理学院
海峡成功学院
生态与资源工程学院
土木工程与建筑学院
机电工程学院
数学与计算机学院
艺术学院
旅游学院
商学院
人文与教师教育学院
茶与食品学院
建议：
旅游学院依托武夷山得天独厚的双世遗产地优势和较为成熟的旅游产业链，形成了产、学、研一体化的系统教学模式，是福建省重点学科。
现代信息服务学院是按照党的“十七大”报告和福建省“十一五”发展规划要求，经福建省教育厅正式批准的武夷学院内部学院，是独立二级学院，以校企合作的模式办学。
这些学院涵盖了经济学、教育学、文学、理学、工学、农学、管理学、艺术学等多个学科门类，为学生提供了广泛的学术和职业发展选择。