2016年上海市大学排名如下：
复旦大学，全国排名第3，总分82.79，办学类型为中国研究型，星级排名为6星级，办学层次为中国顶尖大学。
上海交通大学，全国排名第7，总分81.76，办学类型为中国研究型，星级排名为6星级，办学层次为中国顶尖大学。
同济大学，全国排名第19，总分72.85，办学类型为中国研究型，星级排名为5星级，办学层次为中国一流大学。
华东师范大学，全国排名第28，总分69.52，办学类型为中国研究型，星级排名为5星级，办学层次为中国一流大学。
华东理工大学，全国排名第48，总分65.79，办学类型为行业特色研究型，星级排名为4星级，办学层次为中国高水平大学。
上海财经大学，全国排名第64，总分64.96，办学类型为行业特色研究型，星级排名为5星级，办学层次为中国一流大学。
第二军医大学，全国排名第71，总分64.74，办学类型为行业特色研究型，星级排名为5星级，办学层次为中国一流大学。
上海大学，全国排名第75，总分64.41，办学类型为区域研究型，星级排名为3星级，办学层次为中国知名大学。
东华大学，全国排名第79，总分64.24，办学类型为行业特色研究型，星级排名为4星级，办学层次为中国高水平大学。
上海理工大学，全国排名第113，总分63.11，办学类型为区域特色研究型，星级排名为3星级。
建议：
复旦大学和上海交通大学在2016年在全国的排名中均表现优异，位列前三，是上海市乃至全国都非常重视的高等学府。
同济大学、华东师范大学和华东理工大学也位于全国前50名，具有较高的学术水平和研究实力。
对于希望在上海市就读的学生，这些排名靠前的大学是值得优先考虑的。