三本大学收费高的原因主要有以下几点：
民营性质：
三本大学多为民营大学，没有国家拨款，其建设和运营费用主要依赖学生学费。
学历层次：
三本大学位于本科与专科之间，社会对本科学历的认可度较高，因此学费相对较贵，以体现其教育价值。
教育资源有限：
三本大学由于教育资源相对较少，需要投入更多资源来保证教育质量，这些投入最终会反映在学费上。
学生基础条件差：
三本大学的学生基础普遍较差，学校需要投入更多的时间和精力来教学，这也会增加教育成本。
住宿和校园环境：
三本大学的住宿环境和校园环境通常较好，这些都需要大量的资金投入，因此学费也相对较高。
运营成本：
三本大学的运营成本较高，包括教师工资、教学设施、维护费用等，这些费用最终都需要通过学费来弥补。
教育投资不足：
教育投资经费的缺乏直接影响了三本大学的教学、科研、师资和设施建设水平，学校只能通过提高学费来改善教育环境和教学质量。
盈利性质：
三本大学很多是商业性的经营模式，投资商联合教育部门办校，投入的资金全部由学生承担。
综上所述，三本大学收费高主要是由于其民营性质、学历层次、教育资源有限、学生基础条件差、住宿和校园环境较好、运营成本高、教育投资不足以及盈利性质等多方面因素共同作用的结果。