南疆地区的二本大学包括以下几所：
伊犁师范大学：
位于新疆伊犁，是一所公办的二本大学。
喀什大学：
位于新疆喀什，也是一所公办的二本大学。
新疆工程学院：
位于新疆乌鲁木齐，是一所公办的二本大学。
新疆第二医学院：
位于新疆，是一所公办的二本大学。
昌吉学院：
位于新疆昌吉，是一所公办的二本大学。
新疆警察学院：
位于新疆，是一所公办的二本大学。
新疆政法学院：
位于新疆，是一所公办的二本大学。
新疆理工学院：
位于新疆，是一所公办的二本大学。
新疆科技学院：
位于新疆，是一所公办的二本大学。
新疆天山职业技术大学：
位于新疆，是一所公办的二本大学。
这些大学在地理位置上涵盖了南疆的主要城市，包括喀什、伊犁、乌鲁木齐等，涵盖了师范、工程、医学、财经、艺术等多个学科领域。建议学生在选择学校时，可以根据自己的兴趣和专业需求，综合考虑学校的地理位置、学科设置和教学质量等因素。