南京的二本大学转本（专科生升本科）的院校包括：
南京工业大学
南京工程学院
南京林业大学
南京晓庄学院
金陵科技学院
南京师范大学中北学院
金陵科技学院龙蟠学院
淮阴工学院江淮学院
东南大学成贤学院
南京晓庄学院行知学院
南京大学
东南大学
南京航空航天大学
南京理工大学
南京师范大学
南京财经大学
南京信息工程大学
南京审计大学
南京农业大学
三江学院
南京特殊教育师范学院
江苏警官学院
建议：
南京工业大学和 南京工程学院是理科生转本较好的选择，尤其是南京工程学院的会计学等专业较为热门。
南京晓庄学院行知学院和 金陵科技学院龙蟠学院对文理科生的分数要求相对较低，适合分数不太理想的学生。
南京大学和 东南大学等一本大学也接受专转本学生，但竞争较为激烈，需要较高的分数和优秀的选测等级。
南京信息工程大学等公办一本双一流院校也是转本的好选择。
请根据自身的专业兴趣、分数情况和职业规划，选择合适的院校和专业进行报考。