三本大学的学费之所以贵，主要原因可以归纳为以下几点：
商业性经营模式：
三本大学通常是由投资商联合教育部门办的学校，其投入的资金全部由学生承担，而一本和二本的学校则得到地方财政和国家教育部的联合财政补贴。
缺乏政府财政支持：
三本大学作为民办大学，没有政府财政拨款，其收入主要依赖学费和其他杂费。这使得三本大学的运营成本较高，因此学费也相应较高。
较高的运营成本：
三本大学在教师工资、教学设施等方面的支出几乎全部由学校自身承担，没有国家财政的支持，导致其运营成本较高，从而推高了学费。
盈利目的：
三本大学以盈利为目的，而其他二本以上的学校基本都是半公益性质的。这种性质上的差异也导致三本大学的学费较高。
专业与学历层次：
三本大学通常位于本科层次中的第三批次录取，其录取分数与其他本科学校相差较大，社会对三本大学的认可度相对较低，因此学费需要相对较高以维持其运营和发展。
综合以上几点，可以得出结论：三本大学的学费之所以贵，主要是因为其商业性经营模式、缺乏政府财政支持、较高的运营成本、盈利目的以及专业与学历层次等因素。虽然学费较高，但三本大学也提供相对较高的教育平台和发展机会，家长和学生需要根据自身情况进行选择。