三本大学合并的原因主要有以下几点：
消除学历歧视
三本院校往往被认为是没有考上二本的学生才去读的，这种观念导致了对三本院校的偏见。合并三本和二本院校有助于减轻这种学历歧视，使得所有本科高校在同一批次竞争，从而更重视学生的实际能力而非仅仅是学历。
打破就业歧视
很多单位在招聘时将一本和二本院校作为硬性条件，三本院校的学生往往被排除在外。合并二本和三本院校可以减轻这种就业歧视，使得更多学生有机会获得更好的就业机会。
修正办学目标
一些高中将一本和二本录取率作为办学目标，这背离了教育的初衷，使得教育越来越应试化。合并三本和二本院校有助于回归教育的本质，重视学生的全面发展和能力培养。
推进公办民办一体化
合并三本和二本院校有助于消弭公办和民办高校之间的界限，使高校之间的竞争更多地体现在办学实力上，而不是仅仅在招生和录取上。
提升国民整体素质
合并三本和专科院校可以让更多学生有机会接受高等教育，从而提升国民整体素质。虽然合并后学生仍然获得三本或专科的文凭，但这并不影响他们的学历，只是提供了一个更广泛的接受高等教育的机会。
促进教育公平竞争
合并二本和三本院校有助于实现教育公平竞争，鼓励高校办出自己的特色，培养更具竞争力的人才。学生可以根据自身条件有更多的选择，同时减少就业歧视。
响应国家政策
国务院《实施意见》明确提出要逐步取消高校招生录取批次，合并二本和三本院校是这一政策的具体体现，有助于实现高校毕业生平等竞争就业。
形成规模效应
合并三本和二本院校可以形成规模效应，提高教育资源的利用效率，增强高校的学科竞争力和社会影响力。
综上所述，三本大学合并有助于消除学历和就业歧视，修正办学目标，推进公办民办一体化，提升国民整体素质，促进教育公平竞争，并响应国家政策。虽然合并过程中可能会带来一些挑战，如填报志愿的难度增加，但总体而言，这一举措有利于推动教育公平和高校特色发展。