三本大学 不是独立学校。三本大学主要是指“独立学院本科院校”等，是“公办民助范畴”的大学。三本大学与二本、一本大学相比并没有本质的区别，学制都一样是四年，但三本的学费较贵，一般是1万-3万不等，而一本和二本大学的学费一般在5、6千左右。
独立学院是实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合作，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校。独立学院是民办高等教育的重要组成部分，属于公益性事业。三本大学多为一本、二本大学与民营企业合作单独设立的独立学院，当三本大学转设为民办大学时，会与举办方脱离关系。
因此，三本大学与独立学院在性质上有所不同，三本大学通常是由公办大学与民营企业合作举办的独立学院，而独立学院不一定都是三本大学。