国立清华大学和清华大学的主要区别包括：
英文名称缩写不同
国立清华大学：NTHU
清华大学：THU
地理位置不同
国立清华大学位于中国台湾省新竹市
清华大学位于中国北京市
主管部门不同
国立清华大学主管部门为中国台湾地区教育主管部门
清华大学主管部门为中华人民共和国教育部
学院设置不同
国立清华大学设有理学院、工学院、生命科学院、电机资讯学院、人文社会学院等
清华大学设有建筑学院、环境学院、人文学院、美术学院、药学院等
学校历史和发展
清华大学始建于1911年，初名清华学堂，后更名为清华学校，1928年更名为国立清华大学。1949年中华人民共和国成立后，清华大学进入新的发展阶段。
国立清华大学在1955年于中国台湾省新竹市复校。
学校规模和排名
国立清华大学在国际上的排名大约为163位，世界学科中只有一项进入前50名。
清华大学全世界综合排名为16位，有24个学科进入世界前50名，属于全世界名校，也是中国最顶尖的学校之一。
两所学校虽然名称相似，但分别位于中国台湾和北京，有着不同的历史背景、主管部门、学院设置以及学术研究方向。它们都是各自地区及国际上享有盛誉的高等教育机构