三本大学的真实身份主要包括以下几种：
独立学院：
独立学院是由普通高校申请和举办，但教学和管理由公办高校负责并保证教学质量的学院。它们通常与民营企业合作，属于民办范畴。
民办本科高校：
这些高校完全由私人或民营企业出资创办，不涉及公办高校的合作。
中外合作办学专业：
部分本科高校的中外合作办学专业也属于三本范畴，这些专业通常由公办高校与外国教育机构合作举办。
需要注意的是，虽然三本大学在招生批次上被列为第三批，但它们在学历上仍然属于本科层次。学生完成学业后，可以拿到“本科毕业证书”和“学士学位证书”。
此外，随着各省份对本科批次的合并，一些三本大学已经转设为民办大学，与举办方脱离关系。因此，三本大学的真实身份可能会随着政策和教育改革的进展而发生变化。
综上所述，三本大学主要是由独立学院和民办本科高校构成，这些学院和高校在性质上属于民办范畴，但在学历层次上仍属于本科。