三本大学的独立学院在未来主要有以下几种出路：
继续作为独立学院存在
部分独立学院在改革过渡期满后，可能会选择继续作为独立学院存在，但这种情况相对较少，因为大多数独立学院都在寻求转设或与其他教育机构合并。
转设为民办高校
这是目前独立学院最主要的出路之一。独立学院在脱离公办院校母体后，大多数选择转为民办本科院校。转设后，独立学院可以获得更多的办学自主权，管理机制也会更加灵活。
转设为公办高校
部分独立学院在地方政府的支持下，成功转设为公办本科院校。这种情况相对较少，但转设为公办高校意味着独立学院可以获得更多的政府支持和资源。
撤销或合并
由于各种原因，如办学质量不高、社会需求变化等，部分独立学院可能会选择撤销或与其他教育机构合并。这种情况虽然存在，但比例不高。
应用型、技能型人才培养
由于独立学院在生源文化知识积累方面相对薄弱，它们通常会在应用型、技能型人才培养方面积极想办法，以便更好地适应社会需求和提高毕业生的就业竞争力。
建议
努力提升自身能力：无论选择哪种出路，学生都应该努力提升自身的学习能力和技能，以应对未来的挑战。
关注政策变化：独立学院的转设和政策变化密切相关，学生需要密切关注相关政策和信息，以便做出最适合自己的选择。
拓展就业渠道：独立学院的学生可以通过多种渠道拓展就业机会，包括就业市场、实习、创业等。
总之，三本大学的独立学院在未来有多种出路，学生可以根据自身情况和职业规划，选择最适合自己的发展方向。