山西的三本大学中，以医学专业为主的有以下几所：
山西医科大学晋祠学院
成立于2002年，是经教育部和山西省人民政府批准，由山西医科大学主办的独立学院。该学院是山西省唯一一所以医学专业为主实施全日制本科教育的学院。
山西大学商务学院
成立于2001年，虽然是一所综合性大学，但其医学专业也较为知名。
山西财经大学商学院
该学院虽然以商学院命名，但其医学专业也有一定的实力。
山西科技学院
成立于2021年，是一所理工类应用型高校，虽然主要侧重于理工科，但也可能设有医学相关专业。
根据以上信息，山西医科大学晋祠学院在医学专业方面具有明显优势，是山西省内医学专业最为突出的三本大学。建议您在选择医学专业时，可以优先考虑山西医科大学晋祠学院。