北京最难二本大学可能包括以下几所：
北京中医药大学：
虽然是一所一本大学，但在北京市考生中，其分数相对较高，最低需要532分。
北京联合大学：
被当地人口认为是较差的二本，主要因为其规模和实力不匹配，实力与规模不匹配，校内一个博士站点都没有，唯一拿得出手的两个专业考古和工商管理，在第五轮学科评选中，仅仅是C等级。尽管如此，由于有“北京”这两个字保驾护航，分数线一直不低，外地考生报考至少要550分。
北京城市学院：
虽然分数线不低，软件工程、计算机等专业都在550分以上，但在当地人眼中，它甚至算不上正经八本的本科，顶多是一所“三本”。
北京体育大学：
虽然是一所体育类211建设高校，但专业有限，如运动康复和民族传统体育，毕业后很难找到工作，几乎是毕业即失业。此外，北京本地人一般优等体育生会选择进清华北大的高等运动队，因此北京体育大学在北京人眼中地位较低。
北京工业大学耿丹学院、 北京邮电大学世纪学院、 首都师范大学科德学院等：这些学院被北京收分较低，属于较差的二本大学。
建议：
北京中医药大学虽然分数较高，但其多个专业具有吸引力，如果考生有志于这些专业，可以考虑报考。
北京联合大学和 北京城市学院虽然在外地考生中分数线不低，但在本地人心目中地位较低，考生可以根据自身兴趣和职业规划仔细考虑。
北京体育大学专业有限且就业前景一般，建议考生慎重选择。
对于收分较低的学院，如 北京工业大学耿丹学院、 北京邮电大学世纪学院、 首都师范大学科德学院等，考生可以根据自身分数和兴趣选择报考，但需注意这些学院的整体实力和专业质量。