南京的三本专业大学包括：
1. 南大金陵学院
2. 南师中北学院
3. 南京中医药大学翰林学院
4. 南艺尚美学院
5. 东大成贤学院
6. 南邮通达学院
7. 南审计金审学院
8. 南财红山学院
9. 中国传媒大学南广学院
10. 南航金城学院
11. 南工大浦江学院
12. 南京信息工程大学滨江学院
13. 南京工程学院康尼学院
14. 金陵科技学院龙蟠学院
15. 南京医科大学康达学院
这些学院都是经国家教育部批准设立的三本独立学院，每所学院在不同学科领域都有自己的特色和优势。建议学生在选择学校时，可以综合考虑各学院的学科优势、师资力量、校园环境等因素。