圣约翰大学提供多种专业的学士学位和硕士学位。以下是一些本科和硕士专业的例子：
本科专业
东亚研究
会计
精算
广告学
生物化学
生物
化学
传媒
计算机科学
信息技术
设计
牙医
教育学
英语文学
环境科学
电影制片
数字媒体
金融与银行学
地质学
历史
商务
酒店管理
旅游管理
新闻学
管理信息系统
市场营销
数学
统计学
哲学
物理学
政治科学
心理学
社会工作
摄影艺术
幼儿教育
经济学
美术
法学
文学
医疗科技
药剂学
风险管理
体育管理
通讯
硕士专业
会计
生物化学
生物
化学
教育学
英语文学
金融与银行学
历史
国际商务
法律
管理信息系统
市场营销
数学
统计学
政治科学
心理学
幼儿教育
经济
国际金融
计算机
风险管理
税务
药学
圣约翰大学还提供在意大利罗马的无薪实习机会，以及多样化的专业设置，包括人类学、经济学、英语、环境研究、法语、政治学、历史、意大利语、数学、哲学、心理学、公共管理与公共服务、社会学、西班牙语、演讲、发声病理学与听觉学、神学等。