2016年厦门的二本大学包括以下几所：
厦门理工学院：
厦门理工学院是一所福建省属公立本科大学，也是福建省重点建设高校。前身鹭江职业大学是福建省最早的全日制职业技术大学。2004年，厦门理工学院经教育部批准升本并更名为“厦门理工学院”。
厦门医学院：
厦门医学院是福建省属公办普通本科高等学校，也是福建省三所医学类本科高校之一。学校前身为厦门护士学校、厦门医士学校和厦门助产学校，于1953年因三校合并而创建中专厦门卫生学校，后历经多次更名和发展，2016年经教育部批准设立为厦门医学院。
集美大学：
集美大学是福建省重点建设高校，交通运输部与福建省、自然资源部与福建省、福建省与厦门市共建高校，福建省一流大学和一流学科建设高校，国家“卓越工程师教育培养计划”试点高校，国家“卓越农林人才教育培养计划”试点高校，应急管理学院建设首批试点学校，福建省首批“海外华文教育基地”。
诚毅学院：
诚毅学院是厦门工学院所属的民办学院，也是厦门二本大学之一。
厦门工学院：
厦门工学院是一所民办普通本科高校，位于福建省厦门市。
建议：
厦门理工学院和 厦门医学院在2016年都是福建省内较为知名的二本大学，且都有多个专业可供选择。
集美大学虽然是一所一本大学，但其部分专业也在二本批次招生。
诚毅学院和 厦门工学院作为民办院校，在二本批次也有一定的招生名额。
考生可以根据自己的兴趣和专业倾向，综合考虑这些学校的录取情况和专业特色，选择最适合自己的学校。