三本大学与一本和二本大学之间存在明显的差别，这些差别主要体现在以下几个方面：
办学层次和性质
一本大学通常是部委直属大学、"211工程"大学或985大学，属于公办范畴，是高考第一批录取的大学。
二本大学多为省属大学或非"211工程"大学，是高考中第二批录取的大学。
三本大学主要是指独立学院本科院校等，属于公办民助范畴的大学。
毕业证信息
一本大学和二本大学的毕业证上通常书写的是“某某大学”或“某某学院”，相对容易识别。
三本大学的毕业证信息则因独立学院或民办本科的性质而有所不同，可能书写为“某某大学某某学院”或较为复杂的名字。
学费
一本和二本的学费相对较低，一般相差不大，而三本的学费通常较高，往往是一二本的几倍。
学校硬件设施和软件设施
一本大学通常拥有较好的科研条件和师资力量，位于省会城市，学习氛围浓厚。
二本大学的硬件设施和师资力量相对较弱，但比三本大学要好一些。
三本大学的硬件设施虽然不错，但师资力量通常不如一本和二本，导致教学质量相对一般。
社会认可度和含金量
一本大学的毕业生在就业市场上通常具有更高的认可度和竞争力，企业更倾向于招聘一本大学的学生。
二本和三本大学的毕业生在就业市场上相对处于劣势，尤其是三本大学的学生，可能会面临更大的就业压力。
招生批次
一本、二本和三本在每年的高考招生中，招生批次是不一样的，一般都是按照一本、二本、三本的顺序来完成招生。
综上所述，虽然三本大学也是本科学历，但在办学层次、毕业证信息、学费、学校硬件设施和软件设施、社会认可度和含金量等方面，与一本和二本大学存在明显的差别。因此，在选择大学时，考生应根据自己的实际情况和职业规划，综合考虑这些因素。