海关管理专业的二本大学包括：
上海海关学院
上海海关学院被誉为“海关界的黄埔军校”，是全国唯一一所以海关管理为特色的学府。学院设有12个本科专业，注重跨学科教学，培养具有特殊技能的人才。毕业生就业率高达91.19%，与全国海关单位和大型外贸企业关系紧密，提供了丰富的实习和就业机会。
天津理工大学
虽然不是大红大紫的学校，但在理工科领域具有较高学术水平，在全国二本大学中排名第七。学校与海关系统和外贸公司也有紧密的合作关系。
中国劳动关系学院
作为一所政法类二本大学，其法学、劳动关系等专业在考公考编时非常受欢迎，毕业生基本能进入公务员系统。
贵州医科大学
虽然主要特色是医药类，但在二本大学中排名第二名，具有较高声誉。
温州医科大学
医药类大学中位居前十，全国排名进入前百强。
江苏海洋大学 、 宿迁学院、 江苏师范大学科文学院
这些院校在海关管理专业方面也有一定的招生名额，虽然规模较小，但显示出海关系统开始重视实际能力。
建议：
上海海关学院无疑是海关管理专业二本大学中的佼佼者，具有极高的行业认可度和就业率，建议优先考虑。
天津理工大学和 中国劳动关系学院也具备较好的学术和行业背景，适合对理工科和政法类有兴趣的学生。
贵州医科大学和 温州医科大学虽然主要特色是医药类，但在二本大学中排名较高，也具备一定的竞争力。
江苏海洋大学、 宿迁学院、 江苏师范大学科文学院等院校虽然规模较小，但在海关管理专业方面也有一定的招生名额，可以作为一个选择。